| ①本堂 |
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国宝。徳川家光の寄進により寛永10年（1633年）に再建されたもの。「清水の舞台」とも呼ばれる。屋根は寄棟造、檜皮葺きで、正面（南面）左右に入母屋造の翼廊が突き出し、外観に変化を与えている。建物の前半部分は山の斜面にせり出すようにして建てられ、多くの長大なケヤキの柱（139本という）が「舞台」と呼ばれるせり出し部分を支えている（釘は使われていない）。このような構造を「懸造（かけづくり）」、あるいは「舞台造」と言い、観音菩薩は補陀洛山（ふだらくさん）に現われるという『法華経』「観世音菩薩普門品」（観音経）の所説に基づくものである。なお、同じく観音霊場である長谷寺や石山寺の本堂も同様の「懸造」である。
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| ②仁王門 |
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境内入口に建つ朱塗りの門。三間一戸楼門、入母屋造、檜皮葺きで、正面左右に鎌倉時代末期の金剛力士（仁王）像を安置する。室町時代の建立で、馬駐（うまとどめ）、鐘楼とともに寛永6年（1629年）の大火をまぬがれた。 |
| ③西門 |
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仁王門をくぐって右方の小高い位置に建つ。寛永8年（1631年）の建立。切妻造、檜皮葺きで、形式的には八脚門だが、正面に向拝、背面には軒唐破風（のきからはふ）を付し、内部には床板と格天井を張る特殊な形式の門である。全面朱塗り、軒下の組物や蟇股（かえるまた）などは極彩色とするなど、門というよりは神社の拝殿のように見え、特殊な用途をもった建物と推定されている。 |
| ④三重塔 |
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西門の先に建つ和様の塔。寛永再興時の再建。高さ30.1メートル。昭和62年（1987年）に完了した解体修理により、外部の極彩色が復元されている。内部には、曼荼羅の密教世界が造形されて、中央には大日如来が安置されている。 |
| ⑤随求堂 |
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仁王門から参道を進んだ正面に位置する。もとは塔頭慈心院の本堂で、慈心院を中興した僧・盛松により、享保20年（1735年）に建立された。本尊の秘仏・大随求菩薩像は八臂の坐像で、享保18年（1733年）の作である。脇侍として吉祥天立像と毘沙門天立像（重要文化財）を安置していたが、後者は宝蔵殿に移されている。堂の地下の暗闇を歩く「胎内めぐり」が行われている。 |
| ⑥経堂 |
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三重塔の隣に建つ入母屋造、瓦葺きの五間堂。寛永再興時の再建。内部には釈迦三尊像（脇侍は文殊菩薩と普賢菩薩）を安置する。堂は工芸品などの展示場として使用されることもある。 |
| ⑦開山堂 |
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経堂の隣に建つ入母屋造、瓦葺きの三間堂。開山堂とも称する。寛永再興時の再建。内部には開放形の厨子内に坂上田村麻呂夫妻像を安置し、その向かって左に行叡と延鎮の像を祀る。いずれも清水寺創建に関わる人物である。堂内は通常は非公開。 |
| ⑧朝倉堂 |
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拝観受付所と本堂を結ぶ廊下の北側にある。入母屋造、瓦葺きの五間堂。清水観音を篤く信仰した、越前の守護大名朝倉貞景の寄進した建物だったことから朝倉堂と称するが、現在の建物は寛永再興時の再建。内部には秘仏の千手観音、毘沙門天、地蔵菩薩の三尊のほか、西国三十三所の観音像を安置する。堂内は通常は非公開。 |
| ⑨釈迦堂 |
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本堂の先の山腹に建つ、寄棟造、檜皮葺きの三間堂。寛永再興時の再建。昭和47年（1972年）の集中豪雨による土砂崩れで倒壊し、3年後に旧材をもって復元された。 |
| ⑩音羽の滝 |
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奥の院の建つ崖の下にある、清水寺の寺号の由来である霊水で、3本の筧（かけい）から水が流れ落ちている。 |
| ⑪子安の塔 |
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奥の院前の道を南の清閑寺方面へ歩いた先にある、塔頭・泰産寺の三重塔。寛永再興時の再建。高さは15メートルで、仁王門近くにある三重塔の約半分である。元は仁王門下の南側、警備詰所のあたりにあったが、明治44年（1911年）現在地に移築された。名前のとおり、安産に大きな信仰を集めてきた。 |
| ⑫地主神社 |
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本堂の北にある、元は清水寺の鎮守社で、現在では縁結びの神として信仰を集めている。本殿、拝殿、総門は清水寺本堂と同じく寛永10年（1633年）の再建である。ちなみに清水寺・仁王門前にある狛犬は地主神社のものである。明治の神仏分離により清水寺から独立しているが、歴史的経緯から世界遺産「古都京都の文化財」の清水寺の一部として登録されている。
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